请问租房签合同写明每月打房租到指定帐号，可后来直接用微信转租金给房主这样可以吗？

如果合同有约定，最好还是按照合同约定转账，如果更改一下合同的内容。

如果确实没有没有按照合同约定通过指定账户支付房租，而是通过微信转账支付房租，并且也没有更改合同内容，建议在转账的时候备注清楚“房租”或者“X月房租”。如果直接转账不加备注，对方可以称是其他资金往来，添加备注可以方便日后产生纠纷举证。